Le Programme Eau Potable et Assainissement de Base a pour objectif stratégique d’améliorer l’accès à l’eau potable et aux services d’assainissement, afin de réduire les maladies hydriques. Il se divise en plusieurs actions : l’eau potable en milieu urbain, qui vise à développer des infrastructures, à coordonner les investissements de l’État et du secteur privé, à mettre en place une politique tarifaire et à garantir la qualité de l’eau ; l’eau potable en milieu rural, qui se concentre sur l’extension des réseaux d’approvisionnement en eau potable, la promotion de l’implication privée, et la gestion durable des ressources en eau ; l’assainissement de base, qui cherche à développer des infrastructures d’assainissement, à établir un cadre légal et tarifaire, à promouvoir l’assainissement communautaire et à garantir la sécurité sanitaire des installations ; et les études d’adductions d’eau potable et des infrastructures d’assainissement, qui consistent à analyser les besoins en eau et assainissement, évaluer les infrastructures existantes, et concevoir de nouveaux projets. Ce programme vise également à coordonner les actions avec des partenaires régionaux et internationaux, à respecter les normes de gestion de l’eau, et à assurer un suivi rigoureux de l’efficacité des projets. Actuellement,ce programme est dirrigé par Dr Jean Claude MVUYEKURE.